在喷雾干燥机生产中产生了大量的粉尘、噪声、油雾、固体废弃物等污染排放。在喷雾干燥设备操作过程中产生的多种污染物中，粉尘是主要的副产品。粉尘是悬浮于气体介质中的小固体粒子，能因重力作用发生沉降，但在某一段时间内能保持悬浮状态，具有扩散性且不易控制。粉尘直接影响生产车间的环境，带来职业健康与安全问题，因此在操作使用喷雾干燥设备过程中我们要合理的控制其所产生的粉尘，喷雾干燥设备粉尘控制主要从以下几方面进行：
       对喷雾干燥机局部密封、整体密封或者密闭小室等，将喷雾干燥设备的产尘点用密封罩封住，可减少物料散落和扬尘；喷雾干燥设备的高度势能差是由搬运设备的料斗、防护罩、溜槽等因粉料落差所产生的，如果减少落差，有些密闭室就会造成负压，可有利于粉尘的收集，以免扩散；选择密封性能较好的运输设备，减少卸料物流的高差和倾角，使得各作业间的配置变得灵活、高效，亦能减少散落和扬尘；为了减少粉尘污染，也可以通过排风系统除去室内粉尘。
       为了减少粉尘的飞扬，喷雾干燥机中的气体速度不宜过高，对粒径为1mm左右的物料气速为0.3-1.0m/s；对粒径为5mm左右的物料，气速在3m/s以下。对于可抗高温且不怕污染的物料，除热空气外，烟道气也可作为烘干介质，以获得较高的烘干速率和热效率。